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蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定

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蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定

  • 品 牌

    赛默飞

    型 号

    Q Exactive/Q Exactive-plus 质谱仪

  • 模 式

    • 选 项

      • 地 址

        北京

      • 价 格

        1500

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  • 详细介绍
仪器简介

利用LC-MS/MS技术对单一胶条(SDS-PAGE)、IP、Co-IP、Pull-down纯化溶液等中等复杂样本进行蛋白鉴定。与传统的蛋白质鉴定中经常用到的MALDI-TOF质谱系统相比,LC-MS/MS方法灵敏度更高、鉴定到的蛋白肽段覆盖率更好、结果更加可信。可用于单一蛋白质和简单蛋白混合物的鉴定。

仪器参数

蛋白质鉴定的原理是基于鸟枪法(Shot-gun),将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。


检测项目

可以进行以下样品的鉴定:

1. 1D-SDS PAGE胶条中蛋白的鉴定;
2. 2DE PAGE中蛋白胶点的鉴定;
3. 蛋白表达产物的验证;
4. 免疫共沉淀(Co-IP)样品中蛋白的鉴定;



样品要求
仪器简介

利用LC-MS/MS技术对单一胶条(SDS-PAGE)、IP、Co-IP、Pull-down纯化溶液等中等复杂样本进行蛋白鉴定。与传统的蛋白质鉴定中经常用到的MALDI-TOF质谱系统相比,LC-MS/MS方法灵敏度更高、鉴定到的蛋白肽段覆盖率更好、结果更加可信。可用于单一蛋白质和简单蛋白混合物的鉴定。

仪器参数

蛋白质鉴定的原理是基于鸟枪法(Shot-gun),将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物,经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分,进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对,结合匹配度打分及错配过滤,可得到肽段的确切序列,进而拼接出各蛋白的完整序列,从而实现对蛋白的鉴定。


测试项目

可以进行以下样品的鉴定:

1. 1D-SDS PAGE胶条中蛋白的鉴定;
2. 2DE PAGE中蛋白胶点的鉴定;
3. 蛋白表达产物的验证;
4. 免疫共沉淀(Co-IP)样品中蛋白的鉴定;



样品要求

液体样品(In solution format)

1. 假如样品中蛋白量>10ug,我们对样品的缓冲体系没有要求;
2. 假如样品中蛋白量<10ug,样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用,并注意降低盐浓度;
1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验;
2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容,我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验:
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # 
PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 
161-0481 or 161-0480)
3. 银染的样品请不要进行脱色处理
3. 提交样品过程中,注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量;
Co-IP样品
1. 如果您洗脱的样品需要跑胶,请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可;
2. 如果您直接提交洗脱样品,我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行最后一步蛋白的洗脱,保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容;

样品运输
我们推荐您将样品冻干后进行运输,冻干样品中蛋白非常稳定;
液体样品推荐干冰运输,短途运输冰袋也可以;
注意:
利用质谱进行蛋白样品的鉴定,在样品准备过程中需佩戴手套和头套,尽量避免自身角蛋白(keratin)对样品的污染。


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