高通量测序仪租赁服务
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- 详细介绍
仪器简介
一.高通量测序仪功能特点:
1.HiSeq 2500高通量测序仪的测序原理和Genome Analyzer相同,采用稳定的可逆终止法边合成边测序技术。该技术使用4种含有末端阻断基团和不同荧光信号的碱基进行模板互补链的合成,不仅确保了测序的高精确性和高顺序性,而且排除了由重复序列和同聚物导致的测序错误。
2.在光学系统和制造工艺方面,HiSeq 2500在Genome Analyzer的基础上进行了全面改进和提升。光学系统采用2个激光源对Flowcell进行扫描,并使用4台照相机对4种碱基分别进行记录,大幅度减少了不同碱基之间的信号干扰,提高了测序系统的准确度。同时,HiSeq 2500使用了新颖的双表面成像技术,增加了Flowcell的有效面积,从而提高测序产量和降低成本。
二.高通量测序仪技术参数:
1.高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成300G碱基数据,双端读取至少可生成600G碱基数据;在快速运行模式下27h内产生120G数据
2.实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化);快速模式27h
3.运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元
4.数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;
5.双端读取序列:高通量模式读长2x100个碱基;快速模式读长2x150个碱基
6.样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA
7.读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
8.可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%
9.不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品
10.可开展ChiP-seq、小RNA发现的定量、未知物种测序、转录组研究、甲基化研究试剂盒,宏基因组研究、重测序、目标区域重测序。
三.高通量测序仪应用范围:
1.未知物种基因组的从头测序。
2.已经测序物种的基因组重新测序。
3.基因组尺度转录组学分析(Transcriptomics)。
4.基因表达谱及基因调控研究。
5.全基因组小分子RNA(miRNA)分析。
6.染色质免疫互沉淀研究(ChIP)。
7.多重单核苷酸多型性(SNP)分析。
8.甲基化研究。
9.其他表观遗传学研究如磷酸化修饰。
10.蛋白-DNA相互作用研究。
11.染色体重排研究(缺失,插入等等)。
仪器简介
一.高通量测序仪功能特点:
1.HiSeq 2500高通量测序仪的测序原理和Genome Analyzer相同,采用稳定的可逆终止法边合成边测序技术。该技术使用4种含有末端阻断基团和不同荧光信号的碱基进行模板互补链的合成,不仅确保了测序的高精确性和高顺序性,而且排除了由重复序列和同聚物导致的测序错误。
2.在光学系统和制造工艺方面,HiSeq 2500在Genome Analyzer的基础上进行了全面改进和提升。光学系统采用2个激光源对Flowcell进行扫描,并使用4台照相机对4种碱基分别进行记录,大幅度减少了不同碱基之间的信号干扰,提高了测序系统的准确度。同时,HiSeq 2500使用了新颖的双表面成像技术,增加了Flowcell的有效面积,从而提高测序产量和降低成本。
二.高通量测序仪技术参数:
1.高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成300G碱基数据,双端读取至少可生成600G碱基数据;在快速运行模式下27h内产生120G数据
2.实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化);快速模式27h
3.运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元
4.数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;
5.双端读取序列:高通量模式读长2x100个碱基;快速模式读长2x150个碱基
6.样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA
7.读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
8.可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%
9.不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品
10.可开展ChiP-seq、小RNA发现的定量、未知物种测序、转录组研究、甲基化研究试剂盒,宏基因组研究、重测序、目标区域重测序。
三.高通量测序仪应用范围:
1.未知物种基因组的从头测序。
2.已经测序物种的基因组重新测序。
3.基因组尺度转录组学分析(Transcriptomics)。
4.基因表达谱及基因调控研究。
5.全基因组小分子RNA(miRNA)分析。
6.染色质免疫互沉淀研究(ChIP)。
7.多重单核苷酸多型性(SNP)分析。
8.甲基化研究。
9.其他表观遗传学研究如磷酸化修饰。
10.蛋白-DNA相互作用研究。
11.染色体重排研究(缺失,插入等等)。